1959年，西沙群島、南沙群島、中沙群島辦事處設立，由海南行政區(qū)管轄。

1988年，西沙群島、南沙群島、中沙群島辦事處劃歸新成立的海南省管轄。

2012年6月21日，民政部公告宣布，國務院正式批準，撤銷西沙群島、南沙群島、中沙群島辦事處，建立地級三沙市，西沙群島、中沙群島由三沙市直轄。

2020年4月，國務院批準，海南省三沙市設立西沙區(qū)。

三沙市西沙區(qū)管轄西沙群島的島礁及其海域，代管中沙群島的島礁及其海域。